Министерство финансов в письме от 07.10.2013 №03-07-11/41428 рассмотрело налогообложение реализации в нескольких ситуациях.
Основное средство приобретено для осуществления некоммерческой деятельности НЕ за счет средств целевых поступлений и целевого финансирования.
НДС
Согласно п. 2 ст. 170 НК РФ суммы НДС, предъявленные покупателю при приобретении основных средств, учитываются в стоимости основных средств, при приобретении их для осуществления операций, не подлежащих налогообложению. В соответствии с п. 3 ст. 154 НК РФ налоговая база по НДС при реализации такого имущества определяется как разница между ценой реализации с учетом налога и остаточной стоимостью с учетом переоценок. Остаточную стоимость следует определять на основании данных бухгалтерского учета.